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细胞STR分型检测

 行业动态     |      2020-11-22
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  细胞STR分型介绍
 
  短串联重复序列(shorttandemrepeat,STR)是核心序列为2-6个碱基的短串联重复结构。20世纪90年代初,STR基因座首次作为一种重要的遗传标记在人类亲权鉴定中被使用(Edwardsetal.,1992;Edwardsetal.1991)。
 
  细胞STR分型(celllineSTRgenotyping),是选用D19S433、D5S818、D21S11、D18S51、D6S1043、D3S1358、D13S317、D7S820、D16S539、CSF1PO、PentaD、vWA、D8S1179、TPOX、PentaE、TH01、D12S391、D2S1338和FGA等19个具有高度多态性基因座和一个性别基因位点Amelogenin对人源细胞进行STR分型检测。根据STR分型结果对细胞的生长状态(是否存在交叉污染)和细胞的株系进行确认的技术手段。
 
  细胞STR分型的意义
 
  科研成果能够得到重复确认,对于证实科学发现是十分重要的。如果数据无法重复,那么这个结果能否得到业界的认可并为人所追随就是个很大的疑问了。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是从各大细胞库得来,也可能是受赠于其它研究人员。据估计,15-20%的时间里,实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系,或者与其它细胞系发生了交叉污染(1-3)。ATCC以及其它细胞库(CoriellInstituteforMedicalResearch,EuropeanCollectionofCellCultures(ECACC),DeutscheSammlungvonMikrorganismenandZellkulturen(DSMZ),JapaneseCollectionofResearchResources)都收到过提交的“错误”的细胞系,尽管提交者把细胞系提交到上述机构之前,还经过了检验。然而,最终证实这些细胞系还是鉴别错了(4,5)。此外,干细胞也可能被污染,作为干细胞赖以增殖的哺育细胞层,小鼠细胞很容易污染到干细胞中。显然,细胞系遭到污染、特征鉴别错误,将会极大地威胁着基于这些细胞而发表的论文的质量和研究发现的正确性。为此,很多细胞库现在都要对提交来的细胞系进行STR分型检测,并对细胞系之间的交叉污染进行监测。
 
  细胞STR分型检测方法
 
  基于毛细管电泳检测的STR分型检测使用的是多重PCR复合扩增系统,可以同时扩增19个STR位点加1个性别决定位点Amelogenin,每个被分析的人源细胞系都有其独特的DNA重复模式,因此通过与基础图谱进行比对,即可对每一批新细胞系的种类进行确认。
 
  参考文献
 
  1.Drexler,H.G.,Dirks,W.G.andMacLeod,R.A.F.(1999)Leukemia13,1601–7.
 
  2.Drexler,H.G.etal.(2001)Blood98,3495–6.
 
  3.Cabrera,C.M.etal.(2006)Cytotechnology51,45–50.
 
  4.Chatterjee,R.(2007)Science315,928–31.
 
  5.MacLeod,R.A.F.etal.(1999)Int.J.Cancer83,555–63.
 
  6.Buehring,G.C.,Eby,E.A.andEby,M.J.(2004)InVitroCell.Dev.Biol.40,211–5.
 
  7.Liscovitch,M.andRavid,D.(2007)CancerLett.245,350–2.
 
  8.FDA.GeneralRequirementsforLaboratoryControls.21CFR
 
  211.160and21CFR610.18.
 
  9.ATCCConnectionNewsletter(2007)27,2–4.
 
  10.ATCCConnectionNewsletter(2000)21,1–2.
 
  11.Masters,J.R.etal.(2001)Proc.Natl.Acad.Sci.USA98,8012–7.
 
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