细胞STR分型检测流程

首先了解下STR检测流程，先提取细胞DNA, 然后进行PCR扩增及测序，最后进行结果分析。详细检测流程请看下图：

▲图1 STR检测流程

Dr.Cell 采用的细胞STR鉴定方法完全符合美国国家标准局（NIST）颁布的细胞鉴定标准-ANSI/ATCC ASN-0002-2011, 并且在中国CMA认证与司法鉴定许可的实验室进行检测。

STR位点基因分型结果

完整的细胞STR检测报告请查阅（STR Report-Sample），报告上会列出受检细胞系STR基因分型结果附表（图2），表格中将列出所有实际检测位点信息。第2列“Sample”为样本检测得到的STR位点信息, 该结果是根据实际PCR扩增后检测到的片段长度得到的数据信息。第3列为ATCC、DSMZ等数据库中标准细胞STR位点信息。数据库中常规提供9个位点信息，即 Amelogenin, CSF1PO, D13S317, D16S539, D5S818, D7S820, THO1, TPOX, vWA。

▲图2 STR基因分型结果

STR位点基因分型结果峰图

在报告中会给出受检细胞系的STR检测结果峰图（图3），该峰图是实际PCR扩增后检测到的片段长度和分型信息。位点信息与表1（图2）相同。

▲图3 STR基因分型结果峰图

STR: 短串联重复序列（short tandem repeats，STR）也称微卫星DNA（microsatellite DNA）, 通常是基因组中由1~6个碱基单元组成的一段DNA重复序列，由于核心单位重复数目在个体间呈高度变异性并且数量丰富，构成了STR基因座的遗传多态性。

    ▲图4 STR 短串联重复序列

纯合子：Homozygote，指同源染色体在同一基因位点上的两个等位基因相同。即显示单个峰。

杂合子：Heterozygote，指同源染色体在同一基因位点上的两个等位基因不相同。即显示2个峰。

▲图5 STR位点峰图

人源正常组织细胞其STR图谱，一个基因位点仅出现一个或2个峰（更多信息请查阅短串联重复序列 (STR, short tandem repeats) ）。如发生细胞交叉污染现象，基因位点会出现多等位基因，即一个基因位点出现3或4个峰（图6）。当然，也不能排除可能为三倍体等多倍体突变现象。

▲图6 多等位基因峰图

STR位点基因分型结果比对

根据鉴定得到的细胞STR位点信息在ATCC、DSMZ等数据库中进行比对，进入ATCC STR数据库页面（https://www.atcc.org/en/STR_Database.aspx ）输入检测细胞的9个STR位点信息，与ATCC数据库进行对比。

▲图7 ATCC 数据库比对

输入信息后给出比对结果（图8）

▲图8 ATCC数据库比对结果

同样在DMSZ数据库进行数据比对，得到匹配结果。

▲图9 DSMZ数据库比对结果

比对结果中"%Match"（ATCC, 图8）及 "EV" （DSMZ, 图9）列是受检细胞的9个STR位点基因分型数据与数据库中细胞的匹配度。

人源细胞STR鉴定结果判定标准：

1.根据国际细胞鉴定委员会(ICLAC)制定的细胞STR鉴定标准，细胞系的匹配度≥80% 时，认为它们具有相关性，即衍生于共同的祖先细胞；匹配度在55% 至 80% 之间，需要进一步验证相关性；小于55%，表明两者不具有相关性。
2.图谱有效峰为真实的PCR条带;小峰和非特异性条带在计算中忽略不计。
3.本匹配度计算默认依照ATCC的计算规则，少数情况时依照DSMZ的计算规则，若有个性化需求委托方可提前提出。
4.委托方细胞样本若为干细胞，免疫细胞，原代细胞等细胞，且未提交至公开数据库，STR数据与数据库比对无意义。
5.STR数据比对默认ATCC，DSMZ，JCRB等细胞库，也可比对ECACC,COG,CBA,KCLB等数据库或文献，需提前注明被检样本的比对来源。
6.基因座分型只有一个数字，表示该基因座为纯合子；基因座有两个不同数字，表示该基因座为杂合子。